الشمر من البذور التي تساعد علي تحسين عملية الهضم وتحسين صحة الجهاز الهضمي. فتناول مشروب بذور الشمر خلال فترة العلاج من جرثومة المعدة يساعد على تحسين الصحة والجهاز الهضمي ومقاومة المرض. يساعد الشمر على تقليل حدوث الإمساك وانتفاخ والبطن وتقليل الآلام المصاحبة لتعب جرثومة المعدة. يحد مشروب الشمر من حرقان المعدة والذي يعتبر من أكثر الأعراض المزعجة لأصحاب مرض جرثومة المعدة.